Protein–RNA interactions for Protein: Q15771

RAB30, Ras-related protein Rab-30, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30Q15771 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB30Q15771 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB30Q15771 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms