Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SF3A2Q15428 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A2Q15428 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SF3A2Q15428 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms