Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PUM3Q15397 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PUM3Q15397 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PUM3Q15397 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PUM3Q15397 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PUM3Q15397 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PUM3Q15397 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PUM3Q15397 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PUM3Q15397 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PUM3Q15397 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PUM3Q15397 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PUM3Q15397 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PUM3Q15397 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PUM3Q15397 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PUM3Q15397 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PUM3Q15397 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PUM3Q15397 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PUM3Q15397 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PUM3Q15397 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PUM3Q15397 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PUM3Q15397 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PUM3Q15397 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms