Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKD1Q15139 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKD1Q15139 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKD1Q15139 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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