Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDCD1Q15116 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDCD1Q15116 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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