Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRD3Q15059 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRD3Q15059 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
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