Protein–RNA interactions for Protein: Q15047

SETDB1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETDB1Q15047 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SETDB1Q15047 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETDB1Q15047 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms