Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BECN1Q14457 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
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