Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTTNQ14247 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTTNQ14247 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNQ14247 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNQ14247 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNQ14247 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNQ14247 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNQ14247 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNQ14247 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNQ14247 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNQ14247 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
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