Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A2Q14055 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
COL9A2Q14055 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A2Q14055 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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