Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms