Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2H3Q13889 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms