Protein–RNA interactions for Protein: Q13885

TUBB2A, Tubulin beta-2A chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2AQ13885 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB2AQ13885 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB2AQ13885 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms