Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EXOSC2Q13868 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC2Q13868 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms