Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PEX6Q13608 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX6Q13608 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
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