Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTM1Q13496 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTM1Q13496 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
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