Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRPL49Q13405 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MRPL49Q13405 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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