Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NME3Q13232 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME3Q13232 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME3Q13232 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME3Q13232 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME3Q13232 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME3Q13232 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME3Q13232 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME3Q13232 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME3Q13232 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME3Q13232 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME3Q13232 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME3Q13232 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME3Q13232 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME3Q13232 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME3Q13232 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME3Q13232 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME3Q13232 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME3Q13232 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME3Q13232 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME3Q13232 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME3Q13232 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME3Q13232 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME3Q13232 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME3Q13232 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME3Q13232 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME3Q13232 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME3Q13232 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME3Q13232 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME3Q13232 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME3Q13232 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME3Q13232 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME3Q13232 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME3Q13232 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME3Q13232 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME3Q13232 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NME3Q13232 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NME3Q13232 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME3Q13232 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME3Q13232 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME3Q13232 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME3Q13232 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME3Q13232 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME3Q13232 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME3Q13232 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME3Q13232 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME3Q13232 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME3Q13232 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME3Q13232 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME3Q13232 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME3Q13232 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NME3Q13232 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NME3Q13232 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME3Q13232 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME3Q13232 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME3Q13232 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME3Q13232 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME3Q13232 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME3Q13232 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME3Q13232 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME3Q13232 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME3Q13232 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME3Q13232 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME3Q13232 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME3Q13232 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME3Q13232 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME3Q13232 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME3Q13232 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME3Q13232 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NME3Q13232 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NME3Q13232 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NME3Q13232 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NME3Q13232 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NME3Q13232 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NME3Q13232 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NME3Q13232 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NME3Q13232 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME3Q13232 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME3Q13232 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME3Q13232 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME3Q13232 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME3Q13232 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME3Q13232 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME3Q13232 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME3Q13232 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME3Q13232 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NME3Q13232 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME3Q13232 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME3Q13232 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME3Q13232 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME3Q13232 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME3Q13232 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME3Q13232 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME3Q13232 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME3Q13232 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME3Q13232 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME3Q13232 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME3Q13232 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME3Q13232 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME3Q13232 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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