Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CHAF1BQ13112 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHAF1BQ13112 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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