Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN13Q12923 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPN13Q12923 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
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