Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TROQ12816 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TROQ12816 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TROQ12816 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TROQ12816 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TROQ12816 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TROQ12816 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TROQ12816 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
TROQ12816 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
TROQ12816 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TROQ12816 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
TROQ12816 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TROQ12816 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TROQ12816 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.26■■■■□ 3.24
TROQ12816 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
TROQ12816 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
TROQ12816 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
TROQ12816 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
TROQ12816 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
TROQ12816 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TROQ12816 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
TROQ12816 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
TROQ12816 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
TROQ12816 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
TROQ12816 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TROQ12816 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
TROQ12816 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TROQ12816 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TROQ12816 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TROQ12816 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TROQ12816 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
TROQ12816 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
TROQ12816 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TROQ12816 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TROQ12816 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TROQ12816 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TROQ12816 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TROQ12816 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TROQ12816 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TROQ12816 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TROQ12816 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TROQ12816 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TROQ12816 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TROQ12816 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TROQ12816 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TROQ12816 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TROQ12816 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TROQ12816 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TROQ12816 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
TROQ12816 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TROQ12816 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
TROQ12816 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TROQ12816 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TROQ12816 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TROQ12816 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
TROQ12816 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
TROQ12816 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TROQ12816 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TROQ12816 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TROQ12816 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TROQ12816 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TROQ12816 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TROQ12816 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TROQ12816 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TROQ12816 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TROQ12816 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TROQ12816 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
TROQ12816 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TROQ12816 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
TROQ12816 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
TROQ12816 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
TROQ12816 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
TROQ12816 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
TROQ12816 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
TROQ12816 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TROQ12816 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
TROQ12816 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TROQ12816 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TROQ12816 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
TROQ12816 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TROQ12816 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TROQ12816 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TROQ12816 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TROQ12816 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TROQ12816 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TROQ12816 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TROQ12816 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TROQ12816 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TROQ12816 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TROQ12816 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TROQ12816 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TROQ12816 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TROQ12816 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TROQ12816 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
TROQ12816 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TROQ12816 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TROQ12816 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TROQ12816 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TROQ12816 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
TROQ12816 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
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