Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.3 ms