Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EP300Q09472 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EP300Q09472 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EP300Q09472 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EP300Q09472 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EP300Q09472 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EP300Q09472 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EP300Q09472 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EP300Q09472 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EP300Q09472 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP300Q09472 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP300Q09472 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP300Q09472 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP300Q09472 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP300Q09472 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP300Q09472 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP300Q09472 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP300Q09472 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP300Q09472 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP300Q09472 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP300Q09472 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP300Q09472 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EP300Q09472 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EP300Q09472 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EP300Q09472 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EP300Q09472 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EP300Q09472 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EP300Q09472 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EP300Q09472 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP300Q09472 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP300Q09472 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP300Q09472 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP300Q09472 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP300Q09472 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP300Q09472 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP300Q09472 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EP300Q09472 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EP300Q09472 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EP300Q09472 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EP300Q09472 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EP300Q09472 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EP300Q09472 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EP300Q09472 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EP300Q09472 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EP300Q09472 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EP300Q09472 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EP300Q09472 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EP300Q09472 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EP300Q09472 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EP300Q09472 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EP300Q09472 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EP300Q09472 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EP300Q09472 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EP300Q09472 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EP300Q09472 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EP300Q09472 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EP300Q09472 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EP300Q09472 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EP300Q09472 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EP300Q09472 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EP300Q09472 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EP300Q09472 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EP300Q09472 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EP300Q09472 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EP300Q09472 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EP300Q09472 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP300Q09472 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP300Q09472 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP300Q09472 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP300Q09472 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP300Q09472 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP300Q09472 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP300Q09472 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP300Q09472 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP300Q09472 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP300Q09472 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP300Q09472 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP300Q09472 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EP300Q09472 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP300Q09472 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP300Q09472 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP300Q09472 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP300Q09472 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP300Q09472 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP300Q09472 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP300Q09472 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP300Q09472 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP300Q09472 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP300Q09472 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP300Q09472 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP300Q09472 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EP300Q09472 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EP300Q09472 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EP300Q09472 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EP300Q09472 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EP300Q09472 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EP300Q09472 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EP300Q09472 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EP300Q09472 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EP300Q09472 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms