Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms