Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNDQ07001 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNDQ07001 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms