Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	YPL014W	YPL014W	1146 nt		5.51	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	ICY2	YPL250C	411 nt		5.51	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	MAD3	YJL013C	1548 nt		5.51	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	BUD14	YAR014C	2130 nt		5.51	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	FRE3	YOR381W	2136 nt		5.51	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	CBF5	YLR175W	1452 nt		5.51	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	RPT2	YDL007W	1314 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	IXR1	YKL032C	1794 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	YDL012C	YDL012C	324 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	YGR011W	YGR011W	327 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	YIL028W	YIL028W	399 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	MRS3	YJL133W	945 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	ROT2	YBR229C	2865 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	SMP1	YBR182C	1359 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	KCH1	YJR054W	1494 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	OCA5	YHL029C	2040 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	SPO12	YHR152W	522 nt		5.49	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	RPL15B	YMR121C	615 nt		5.49	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	SIP5	YMR140W	1470 nt		5.49	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	MCX1	YBR227C	1563 nt		5.49	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	MUM3	YOR298W	1440 nt		5.48	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	IBA57	YJR122W	1494 nt		5.48	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	RXT3	YDL076C	885 nt		5.48	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	SKI8	YGL213C	1194 nt		5.48	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	RFU1	YLR073C	603 nt		5.48	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	MDY2	YOL111C	639 nt		5.48	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	DXO1	YDR370C	1329 nt		5.48	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	YDL121C	YDL121C	450 nt		5.47	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	YDR417C	YDR417C	372 nt		5.47	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	GLE2	YER107C	1098 nt		5.47	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	YER134C	YER134C	537 nt		5.47	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	PAU17	YLL025W	375 nt		5.47	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	YMR196W	YMR196W	3267 nt		5.47	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	TUB3	YML124C	1338 nt		5.47	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	PCL8	YPL219W	1479 nt		5.46	□□□□□ -1.53
SYF1	Q04048	CPS1	YJL172W	1731 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	ARN2	YHL047C	1863 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	POP3	YNL282W	588 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	TRS33	YOR115C	807 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	snR19	snR19	568 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	GCN20	YFR009W	2259 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	CAF4	YKR036C	1932 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	LYP1	YNL268W	1836 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	ALG6	YOR002W	1635 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	YEL028W	YEL028W	462 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	YGR066C	YGR066C	879 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	YKE4	YIL023C	1041 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	NOP13	YNL175C	1212 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	MCM4	YPR019W	2802 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	RRP1	YDR087C	837 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	YGR153W	YGR153W	654 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	YHR193C-A	YHR193C-A	375 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	COX11	YPL132W	903 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	snR3	snR3	194 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	SLT2	YHR030C	1455 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	CLD1	YGR110W	1338 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	SIA1	YOR137C	1869 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	PHM8	YER037W	966 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	SMA1	YPL027W	738 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	DUR1,2	YBR208C	5508 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	KAR2	YJL034W	2049 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	IFM1	YOL023W	2031 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	UBX7	YBR273C	1311 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	SUP35	YDR172W	2058 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	PRO2	YOR323C	1371 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	CSR1	YLR380W	1227 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	NRM1	YNR009W	750 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	RMI1	YPL024W	726 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	ECM33	YBR078W	1290 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	GSY1	YFR015C	2127 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	ATG32	YIL146C	1590 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	IMD3	YLR432W	1572 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	FPK1	YNR047W	2682 nt		5.41	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	KRE28	YDR532C	1158 nt		5.41	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	MAD2	YJL030W	591 nt		5.41	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	MRPL20	YKR085C	588 nt		5.41	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	YHR182W	YHR182W	2358 nt		5.41	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	EXO70	YJL085W	1872 nt		5.41	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	SAP4	YGL229C	2457 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	RSC6	YCR052W	1452 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	CPR4	YCR069W	957 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	UBC8	YEL012W	657 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	SSY5	YJL156C	2100 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	ISY1	YJR050W	708 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	UIP3	YAR027W	708 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	SPG4	YMR107W	348 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	YOR379C	YOR379C	339 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	QCR2	YPR191W	1107 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	RER1	YCL001W	567 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SYF1	Q04048	HES1	YOR237W	1305 nt		5.4	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	ASK10	YGR097W	3441 nt		5.4	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	GDH2	YDL215C	3279 nt		5.4	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	NRD1	YNL251C	1728 nt		5.4	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	GAD1	YMR250W	1758 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	PHO90	YJL198W	2646 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	IMG2	YCR071C	441 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	SPO74	YGL170C	1242 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	YGR122W	YGR122W	1209 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	tS(AGA)D3	tS(AGA)D3	83 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	YKL169C	YKL169C	384 nt		5.39	□□□□□ -1.55

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