Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAP1Q03518 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAP1Q03518 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAP1Q03518 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms