Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ROM1Q03395 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.3 ms