Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CYP4A11Q02928 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYP4A11Q02928 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP4A11Q02928 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms