Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF17Q02223 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms