Protein–RNA interactions for Protein: Q02086

SP2, Transcription factor Sp2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP2Q02086 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SP2Q02086 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SP2Q02086 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SP2Q02086 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SP2Q02086 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SP2Q02086 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SP2Q02086 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SP2Q02086 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SP2Q02086 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SP2Q02086 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SP2Q02086 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SP2Q02086 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SP2Q02086 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SP2Q02086 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SP2Q02086 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SP2Q02086 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SP2Q02086 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SP2Q02086 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SP2Q02086 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SP2Q02086 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SP2Q02086 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SP2Q02086 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SP2Q02086 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SP2Q02086 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SP2Q02086 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SP2Q02086 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SP2Q02086 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SP2Q02086 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SP2Q02086 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SP2Q02086 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SP2Q02086 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SP2Q02086 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SP2Q02086 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SP2Q02086 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SP2Q02086 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SP2Q02086 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SP2Q02086 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SP2Q02086 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SP2Q02086 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SP2Q02086 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP2Q02086 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP2Q02086 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP2Q02086 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP2Q02086 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP2Q02086 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP2Q02086 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP2Q02086 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SP2Q02086 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SP2Q02086 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SP2Q02086 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SP2Q02086 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SP2Q02086 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SP2Q02086 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SP2Q02086 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SP2Q02086 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SP2Q02086 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP2Q02086 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP2Q02086 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP2Q02086 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP2Q02086 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP2Q02086 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP2Q02086 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP2Q02086 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP2Q02086 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP2Q02086 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP2Q02086 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SP2Q02086 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SP2Q02086 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SP2Q02086 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SP2Q02086 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SP2Q02086 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SP2Q02086 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SP2Q02086 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SP2Q02086 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SP2Q02086 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SP2Q02086 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SP2Q02086 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SP2Q02086 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SP2Q02086 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP2Q02086 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP2Q02086 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP2Q02086 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP2Q02086 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP2Q02086 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP2Q02086 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP2Q02086 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP2Q02086 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SP2Q02086 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP2Q02086 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SP2Q02086 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SP2Q02086 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SP2Q02086 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SP2Q02086 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SP2Q02086 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SP2Q02086 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SP2Q02086 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SP2Q02086 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SP2Q02086 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SP2Q02086 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SP2Q02086 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms