Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SATB1Q01826 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms