Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRCDQ00LT1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRCDQ00LT1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms