Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FANCCQ00597 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCCQ00597 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms