Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK17Q00537 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms