Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK16Q00536 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK16Q00536 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms