Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDKL1Q00532 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms