Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGD1P98174 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGD1P98174 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGD1P98174 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGD1P98174 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGD1P98174 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGD1P98174 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGD1P98174 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGD1P98174 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGD1P98174 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGD1P98174 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGD1P98174 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGD1P98174 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGD1P98174 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGD1P98174 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGD1P98174 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGD1P98174 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGD1P98174 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGD1P98174 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGD1P98174 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGD1P98174 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGD1P98174 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGD1P98174 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGD1P98174 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGD1P98174 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGD1P98174 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FGD1P98174 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FGD1P98174 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FGD1P98174 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FGD1P98174 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FGD1P98174 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FGD1P98174 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FGD1P98174 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FGD1P98174 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FGD1P98174 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FGD1P98174 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FGD1P98174 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FGD1P98174 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FGD1P98174 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FGD1P98174 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FGD1P98174 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FGD1P98174 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FGD1P98174 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FGD1P98174 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGD1P98174 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGD1P98174 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGD1P98174 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGD1P98174 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGD1P98174 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGD1P98174 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGD1P98174 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FGD1P98174 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGD1P98174 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGD1P98174 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGD1P98174 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGD1P98174 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD1P98174 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD1P98174 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD1P98174 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD1P98174 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD1P98174 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD1P98174 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD1P98174 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD1P98174 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD1P98174 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD1P98174 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD1P98174 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD1P98174 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD1P98174 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD1P98174 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD1P98174 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD1P98174 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD1P98174 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD1P98174 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD1P98174 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD1P98174 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD1P98174 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD1P98174 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD1P98174 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD1P98174 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD1P98174 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD1P98174 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD1P98174 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD1P98174 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD1P98174 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD1P98174 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD1P98174 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD1P98174 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD1P98174 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD1P98174 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD1P98174 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD1P98174 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGD1P98174 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGD1P98174 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGD1P98174 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGD1P98174 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGD1P98174 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
FGD1P98174 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD1P98174 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD1P98174 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms