Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VLDLRP98155 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms