Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CRB1P82279 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CRB1P82279 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CRB1P82279 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CRB1P82279 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CRB1P82279 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CRB1P82279 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CRB1P82279 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CRB1P82279 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CRB1P82279 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CRB1P82279 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CRB1P82279 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CRB1P82279 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CRB1P82279 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CRB1P82279 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CRB1P82279 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CRB1P82279 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CRB1P82279 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CRB1P82279 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CRB1P82279 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CRB1P82279 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CRB1P82279 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CRB1P82279 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CRB1P82279 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CRB1P82279 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CRB1P82279 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CRB1P82279 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CRB1P82279 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CRB1P82279 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CRB1P82279 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CRB1P82279 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CRB1P82279 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CRB1P82279 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CRB1P82279 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CRB1P82279 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CRB1P82279 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CRB1P82279 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CRB1P82279 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CRB1P82279 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CRB1P82279 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CRB1P82279 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CRB1P82279 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CRB1P82279 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CRB1P82279 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CRB1P82279 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CRB1P82279 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CRB1P82279 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CRB1P82279 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CRB1P82279 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CRB1P82279 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CRB1P82279 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CRB1P82279 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CRB1P82279 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CRB1P82279 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CRB1P82279 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CRB1P82279 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CRB1P82279 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CRB1P82279 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CRB1P82279 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CRB1P82279 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CRB1P82279 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CRB1P82279 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CRB1P82279 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CRB1P82279 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CRB1P82279 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CRB1P82279 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CRB1P82279 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CRB1P82279 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CRB1P82279 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CRB1P82279 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CRB1P82279 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CRB1P82279 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CRB1P82279 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CRB1P82279 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CRB1P82279 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CRB1P82279 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CRB1P82279 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CRB1P82279 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CRB1P82279 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CRB1P82279 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CRB1P82279 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CRB1P82279 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CRB1P82279 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CRB1P82279 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CRB1P82279 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CRB1P82279 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CRB1P82279 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CRB1P82279 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CRB1P82279 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CRB1P82279 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CRB1P82279 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CRB1P82279 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CRB1P82279 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CRB1P82279 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CRB1P82279 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CRB1P82279 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CRB1P82279 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CRB1P82279 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CRB1P82279 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CRB1P82279 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms