Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL7P80098 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL7P80098 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL7P80098 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL7P80098 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL7P80098 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL7P80098 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL7P80098 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL7P80098 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL7P80098 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL7P80098 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL7P80098 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL7P80098 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL7P80098 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL7P80098 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL7P80098 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL7P80098 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL7P80098 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL7P80098 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL7P80098 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL7P80098 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL7P80098 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL7P80098 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL7P80098 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL7P80098 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL7P80098 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL7P80098 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL7P80098 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL7P80098 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL7P80098 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL7P80098 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL7P80098 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL7P80098 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL7P80098 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL7P80098 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL7P80098 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL7P80098 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCL7P80098 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCL7P80098 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCL7P80098 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL7P80098 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL7P80098 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL7P80098 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL7P80098 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL7P80098 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL7P80098 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL7P80098 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL7P80098 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL7P80098 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL7P80098 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL7P80098 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL7P80098 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL7P80098 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL7P80098 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL7P80098 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL7P80098 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL7P80098 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL7P80098 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL7P80098 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL7P80098 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL7P80098 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL7P80098 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL7P80098 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL7P80098 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL7P80098 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL7P80098 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCL7P80098 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCL7P80098 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCL7P80098 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCL7P80098 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCL7P80098 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCL7P80098 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL7P80098 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL7P80098 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL7P80098 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL7P80098 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL7P80098 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL7P80098 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL7P80098 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL7P80098 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL7P80098 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL7P80098 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL7P80098 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL7P80098 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCL7P80098 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCL7P80098 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCL7P80098 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCL7P80098 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCL7P80098 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCL7P80098 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCL7P80098 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCL7P80098 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCL7P80098 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCL7P80098 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCL7P80098 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCL7P80098 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCL7P80098 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCL7P80098 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCL7P80098 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCL7P80098 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms