Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT85P78386 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT85P78386 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT85P78386 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT85P78386 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT85P78386 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT85P78386 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT85P78386 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT85P78386 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT85P78386 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT85P78386 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT85P78386 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT85P78386 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT85P78386 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT85P78386 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT85P78386 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT85P78386 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT85P78386 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT85P78386 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT85P78386 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT85P78386 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT85P78386 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT85P78386 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT85P78386 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT85P78386 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT85P78386 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT85P78386 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT85P78386 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT85P78386 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT85P78386 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT85P78386 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT85P78386 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT85P78386 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT85P78386 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT85P78386 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT85P78386 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT85P78386 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT85P78386 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT85P78386 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT85P78386 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT85P78386 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT85P78386 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT85P78386 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
KRT85P78386 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
KRT85P78386 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT85P78386 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT85P78386 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT85P78386 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT85P78386 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT85P78386 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT85P78386 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT85P78386 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT85P78386 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT85P78386 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT85P78386 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT85P78386 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT85P78386 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT85P78386 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT85P78386 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT85P78386 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT85P78386 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT85P78386 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT85P78386 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT85P78386 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT85P78386 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT85P78386 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT85P78386 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT85P78386 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT85P78386 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT85P78386 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT85P78386 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT85P78386 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT85P78386 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT85P78386 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT85P78386 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT85P78386 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT85P78386 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT85P78386 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT85P78386 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT85P78386 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT85P78386 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT85P78386 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT85P78386 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT85P78386 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT85P78386 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT85P78386 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT85P78386 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT85P78386 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT85P78386 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT85P78386 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT85P78386 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT85P78386 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT85P78386 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT85P78386 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT85P78386 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT85P78386 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT85P78386 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT85P78386 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
KRT85P78386 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT85P78386 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms