Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBXN2AP68543 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBXN2AP68543 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms