Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTA1P68133 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTA1P68133 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms