Protein–RNA interactions for Protein: P68032

ACTC1, Actin, alpha cardiac muscle 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTC1P68032 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTC1P68032 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTC1P68032 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163 ms