Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P62891 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P62891 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P62891 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P62891 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P62891 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P62891 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P62891 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P62891 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P62891 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P62891 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P62891 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P62891 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P62891 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P62891 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P62891 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P62891 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P62891 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P62891 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P62891 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P62891 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P62891 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P62891 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P62891 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P62891 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P62891 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P62891 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P62891 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P62891 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P62891 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P62891 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P62891 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39P62891 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P62891 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P62891 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P62891 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P62891 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P62891 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P62891 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P62891 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P62891 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P62891 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P62891 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P62891 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL39P62891 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P62891 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P62891 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P62891 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P62891 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P62891 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P62891 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P62891 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P62891 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P62891 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P62891 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P62891 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P62891 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P62891 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P62891 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P62891 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P62891 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P62891 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P62891 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P62891 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P62891 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P62891 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P62891 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P62891 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P62891 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P62891 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P62891 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P62891 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P62891 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P62891 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPL39P62891 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPL39P62891 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPL39P62891 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPL39P62891 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P62891 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P62891 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P62891 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P62891 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P62891 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P62891 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P62891 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P62891 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P62891 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P62891 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P62891 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P62891 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P62891 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P62891 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P62891 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P62891 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P62891 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P62891 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P62891 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P62891 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P62891 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P62891 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms