Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSNL1P62760 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VSNL1P62760 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms