Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11AP62491 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB11AP62491 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB11AP62491 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB11AP62491 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11AP62491 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11AP62491 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11AP62491 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11AP62491 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11AP62491 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11AP62491 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11AP62491 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11AP62491 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11AP62491 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11AP62491 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms