Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SNRPD1P62314 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms