Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPS29P62273 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPS29P62273 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPS29P62273 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPS29P62273 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPS29P62273 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPS29P62273 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPS29P62273 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RPS29P62273 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RPS29P62273 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RPS29P62273 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RPS29P62273 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RPS29P62273 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RPS29P62273 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RPS29P62273 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RPS29P62273 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RPS29P62273 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RPS29P62273 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RPS29P62273 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RPS29P62273 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RPS29P62273 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RPS29P62273 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RPS29P62273 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RPS29P62273 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RPS29P62273 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RPS29P62273 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RPS29P62273 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RPS29P62273 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RPS29P62273 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RPS29P62273 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RPS29P62273 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RPS29P62273 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RPS29P62273 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RPS29P62273 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RPS29P62273 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RPS29P62273 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RPS29P62273 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RPS29P62273 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RPS29P62273 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RPS29P62273 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RPS29P62273 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RPS29P62273 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RPS29P62273 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RPS29P62273 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RPS29P62273 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RPS29P62273 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RPS29P62273 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RPS29P62273 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RPS29P62273 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RPS29P62273 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RPS29P62273 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RPS29P62273 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RPS29P62273 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RPS29P62273 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RPS29P62273 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RPS29P62273 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RPS29P62273 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS29P62273 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS29P62273 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS29P62273 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS29P62273 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS29P62273 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS29P62273 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS29P62273 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS29P62273 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS29P62273 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
RPS29P62273 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS29P62273 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS29P62273 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS29P62273 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS29P62273 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS29P62273 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS29P62273 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS29P62273 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS29P62273 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS29P62273 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS29P62273 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS29P62273 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS29P62273 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS29P62273 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS29P62273 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS29P62273 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS29P62273 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS29P62273 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS29P62273 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS29P62273 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS29P62273 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS29P62273 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS29P62273 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS29P62273 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS29P62273 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS29P62273 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS29P62273 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS29P62273 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS29P62273 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS29P62273 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS29P62273 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS29P62273 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS29P62273 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS29P62273 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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